Microsoft Research、Quine発表　膵がん研究で数千の化合物を優先順位付け

生物学の複数のデータをつなぐ研究システム

Quineは、生物学の「世界モデル」と研究者向けの対話型ツール群を組み合わせる。Microsoftによると、モデルは遺伝子配列、タンパク質の構造や機能、細胞状態、画像など複数の種類のデータを横断して学ぶ。ツール群はモデルを研究用ソフトや文献、研究者につなぎ、問いの整理や予測、実験計画を支援する。

実験をAIが自動で行う仕組みではない。Quineが計算上の候補を示し、研究者が実験で確かめ、測定結果を次の問いに生かす。Microsoftは、実験を置き換えるのではなく、限られた時間や試料をどの仮説の検証に使うかを絞る構想として説明している。

膵がん細胞の状態を変える候補を検証

共同研究では、膵管腺がんの細胞が示す遺伝子発現上の状態に着目した。Microsoftによると、Quineは数千の化合物について、細胞を「classical」から「basal」へ移す可能性を予測して順位付けした。ウェットラボ試験では、上位候補ほど狙った方向への変化が大きかったという。

反対向きの「basal」から「classical」への変化は難しく、Quineも弱い効果を予測していた。さらに、モデルは既知の二状態とは別の表現型へ細胞を動かす候補も予測し、実験でも同様の変化が見られたとMicrosoftは説明する。化合物名や作用機序の詳細は発表されていない。

Microsoftは、数千の候補から実験で試す数個を選ぶまでの計算上の絞り込みが「週末の間」に進んだとしている。この期間は候補の優先順位付けまでを指す。ウェットラボ試験そのものが週末で完了した、という発表ではない。

結果の詳細と再現性はこれから

公開された説明には、試験した化合物や細胞株の数、個々の試験名、変化の大きさ、対照条件、反復数がない。「複数の試験で検証した」という説明はあるが、独立した研究機関で再現したかどうかも示されていない。予測の順位と実験結果が対応したという定性的な報告は、追試に必要な情報を備えた論文とは区別して読む必要がある。

Quineの発表記事はMicrosoft Researchの研究ブログで、今回のPDAC結果を扱う査読論文やプレプリントへのリンクは確認できなかった。細胞状態と周辺環境が膵がんの薬剤応答に関わるという背景には、Broad Instituteなどの研究者が参加した2021年の査読論文がある。ただし、この論文はQuineを評価した研究ではない。

アクセスは研究用途に限定、製品化時期は未定

Microsoftは現在、Quineを初期段階の研究技術と位置づけ、利用をFellowsプログラムと一部の共同研究に限る。公式サイトは初回Fellowsの応募を2026年11月2日まで受け付け、2027年6月から16週間の研究期間を設けるとしている。Microsoftは将来、Microsoft Discoveryのような製品を通じて提供範囲を広げる考えを示したが、Quineの製品統合や一般公開の時期は発表していない。

Quineの出力は不完全または不正確な場合があり、専門家の確認と実験による検証が必要だ。Microsoft自身も診断、治療、臨床判断などへの利用を意図していないと明記している。今回の発表が示すのは、AIが薬を見つけたという臨床成果ではなく、研究者が試す仮説を計算で絞り、実験結果を次の検討に戻す研究手順の初期例だ。